阜新市疾病预防控制中心成立于2003年11月17日，由原市卫生防疫站、市结核病防治所、市健康教育所、市职业病防治所四家单位合并而成。
主要职责是：负责对影响人群生存环境卫生质量及生命质量的危险因素进行食品、职业环境、放射、学校卫生等卫生学监测。对传染病、寄生虫病、慢性非传染性疾病、职业病、公害病、学生常见病及意外伤害、中毒等发生、分布和发展的规律进行流行病学监测，并制定预防控制措施。拟定并实施疾病预防控制工作方案;对传染病的发生流行和中毒、污染事件进行卫生调查及卫生处理，为救灾防病和解决重大公共卫生问题提供技术支持。实施预防接种；开展健康教育与健康促进，参与社区疾病预防控制住服务工作；开展卫生防病检验。受卫生部门认定，对新建、改建、扩建建设项目的选址、设计的竣工验收进行卫生学评价。
中心自成立以来，认真贯彻落实“预防为主，防治结合”的卫生工作方针，不断完善疾病预防控制体系建设，提高疾病预防控制和突发公共卫生事件应急处置能力。先后取得了职业卫生技术服务、职业健康检查（含放射工作人员职业健康检查）、职业病诊断、从业人员健康检查等卫生技术服务资质。现有PCR实验室、艾滋病筛查中心实验室、微量碘实验室、病媒生物实验室等多个实验室，并通过了国家实验室认可及省级实验室资质认定和食品检验机构资质认定。市疾控中心是我市市区内唯一一家具有开展从业人员健康检查资质的单位。
中心始终坚持以服务对象为中心、以服务质量为核心、以服务满意为标准，为全市人民的健康保驾护航。